SyncKolab synchronisiert die Daten auf Wunsch in Intervallen, voreingestellt ist jedoch manueller Abgleich. Sie können festlegen, ob im Falle eines Konflikts lokale oder Server-Daten bevorzugt werden sollen – oder ob SyncKolab nachfragen soll, was zu tun ist.
Zunächst synchronisiert die Erweiterung nur Termine und Aufgaben, die jünger als 180 Tage sind. Trägt man statt der Zahl der Tage bei Kalender und Aufgaben jeweils "-1" ein, so werden alle vorhandenen Termine und Aufgaben berücksichtigt. Falls Sie just während des Synchronisierens auf den Kalender schauen und die Termine vor Ihren Augen verschwinden, müssen Sie sich keine Sorgen machen. Es handelt sich um einen Darstellungsfehler von Thunderbird. Starten Sie das Programm anschließend neu, tauchen alle Termine wie von Zauberhand wieder auf.
Zwar kann man mit SyncKolab ganz ohne Groupware-Server Termine und Aufgaben kleiner Gruppen koordinieren – für Gruppenterminabsprachen et cetera braucht es indes den Kolab-Groupware-Server. Apropos Groupware: Die unter Affero GNU General Public License (AGPL) kostenlos für Windows und Linux erhältliche Community Edition des Funambol Server Bundle 
stellt im Handumdrehen einen lokalen SyncML-Server bereit, der mit Hilfe des Funambol Mozilla PIM Plugin Kontakte und Termine mit Lightning synchronisiert. Während Funambols Outlook-Plug-in auch Aufgaben und Notizen berücksichtigt, bleiben diese bei dem Mozilla-Plug-in momentan noch auf der Strecke.
Der Funambol-Server ist mit wenigen Klicks eingerichtet. Nutzer muss man nicht mühsam einzeln anlegen, sie melden sich einfach mit Nutzernamen und Wunschpasswort bei der ersten Synchronisierung beim Server an. Die entsprechenden Daten trägt man in den Optionen des Funambol-Plug-in in Thunderbird ein. Damit sich nicht sämtliche Termine beim Zurückspielen (Recover) verschieben, müssen Sie im Funambol Administration Tool (voreingestelltes Passwort des "admin" lautet "sa") die Zeitzone der "Devices" – zu denen auch Thunderbird zählt – durch Doppelklick auf die jeweilige automatisch zugewiesene ID an die unter Thunderbird eingestellte anpassen und "Conversion to current TZ" aktivieren.
